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Ce livre traite des divers aspects de la variation des SNP/Indels dans les lign�es de descendance (Tulaipanji x Ranjit) et les ressources g�n�tiques du riz sauvage Oryza rufipogon. Les germoplasmes de riz ont �t� d�crits sur la base des propri�t�s morpho-physicochimiques, de l'analyse GCMS, du MEB des grains et des granules d'amidon. La technologie TILLING/Eco-TILLING bas�e sur la g�n�tique inverse a �t� illustr�e pour l'extraction d'all�les. La m�thode GBS bas�e sur la NGS (Illumina) a �t� employ�e dans cette �tude pour analyser les variations SNP et InDel et leur sch�ma d'introgression dans les lign�es de descendance F5 (P-awn et P-awnless). Le nombre total de SNP identifi�s �tait de 52 810 et celui des indels de 4 327. Ces variantes n'�taient pas r�parties uniform�ment sur les 12 chromosomes (d'apr�s le Golden Helix G Browser). L'�tude a montr� que sur un nombre d'all�les de 10013, 92,52% ont �t� introgress�s dans P-awn � partir de Tulaipanji et 7,485 � partir de Ranjit, en revanche, P-awnless a port� 89,19% � partir de Ranjit et 10,81% � partir de Tulaipanji. Cela est d� � une distorsion de la s�gr�gation. De nombreuses variations SNP sont associ�es � des caract�res importants. Comme la GA20-oxydase (g�ne sd1), l'Argonaute et la prot�ine Dicer avec le domaine PAZ. Fichiers Fastq de quatre lign�es de riz avec NCBI SRA Accession no. SRP077861, SRP077919, SRP077947 & SRP077977.

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9786207350001

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