Overview

Les squences rptes en tandem sont une classe de squences gntiques constitues de motifs adjacents dont font partie microsatellites et minisatellites. Dans cet ouvrage, nous traitons le problme de leur comparaison par alignement. Notre modle considre, en plus des trois oprations classiques: mutation, insertion et dltion, l'amplification en tandem et la contraction en tandem. L'amplification copie un facteur de la squence, c'est--dire un ou plusieurs caractre(s), et met le ou les exemplaire(s) du facteur copi ct du facteur original, la contraction est l'vnement inverse. Nous proposons une mthode donnant un score d'alignement entre deux squences rptes en tandem. Le problme est difficile car les oprations ne sont pas commutatives. Notre solution fait appel de l'algorithmique de graphe. Nous avons ralis un programme nomm MS_Align qui implmente cette mthode. Il s'agit du premier programme capable d'aligner des cartes de minisatellites. l'aide de ce programme, nous avons tudi des donnes biologiques provenant du minisatellite humain MSY1. Comme nous le montrons, notre modle volutif s'applique bien ce type de squences d'ADN.

Full Product Details

9786131509063

Table of Contents

Reviews

Author Information

Tab Content 6

Customer Reviews

Recent Reviews

Countries Available